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1.
Biosci. j. (Online) ; 36(Supplement1): 163-172, Dec. 2020. ilus, tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1355212

ABSTRACT

The objective of the current study was to measure the genetic variability of natural populations of Hancornia speciosa using RAPD type molecular markers to assay variation in existing sampled genotypes, using morphological variables, and so assess germplasm bank composition. Morphological and chemical characteristics H. speciosa fruits and seeds were evaluated using descriptive statistics and principal components analysis. Cluster analyzes was conducted using Jaccard's similarity index, via the UPGMA hierarchical agglomerative method. Phenotypic variability was found in the two studied populations. However, variability was higher in the São Judas population, where the variables: pulp yield and soluble solids content were higher than those in the Canaã population. High genetic variability was found in both study populations, and between- and within-population morphological and genetic variation was present in the studied populations. The nine primers generated 70 bands, of which 68 were polymorphic, with the primers A-08 and C-04 generating the highest number of polymorphic bands. The two populations differ principally in the pulp ratio and the proportion of total solids in the pulp (°Brix). RAPD markers used gave acceptable results and, to initiate the Federal University of Tocantins Active Mangaba Germplasm Bank, seven genotypes were sampled from the Canaã population and five from the São Judas Tadeu population.


O presente trabalho teve como objetivo mensurar a variabilidade genética de populações naturais de Hancornia speciosa utilizando marcadores moleculares do tipo RAPD para validar a amostragem de genótipos, realizada por meio de variáveis morfológicas, para a composição de um banco de germoplasma. Foram avaliadas características morfológicas e químicas de frutos e sementes de mangaba, utilizando-se estatística descritiva e análise de componentes principais. As análises de agrupamento foram feitas utilizando índice de similaridade de Jaccard, através do método hierárquico aglomerativo UPGMA. Foi observada grande variabilidade fenotípica nas duas populações estudas, porém, essa variabilidade foi maior na população São Judas, onde as variáveis: rendimento de polpa e teor de sólidos solúveis foram maiores que os encontrados na população Canaã. Observou-se uma elevada variabilidade genética nas duas populações estudadas e que existe variabilidade morfológica e genética entre e dentro das populações. As duas populações diferem principalmente em relação ao rendimento de polpa e teor de sólidos solúveis totais (°Brix). Os nove iniciadores que amplificaram geraram 70 bandas, destas, 68 foram polimórficas, onde os primers A-08 e C-04 foram os que geraram maior número de bandas polimórficas. Portanto, os marcadores RAPD utilizados foram eficientes no presente estudo e para comporem o Banco Ativo de Germoplasma de Mangaba da Universidade Federal do Tocantins foram amostrados sete genótipos da população Canaã e cinco da população São Judas Tadeu.


Subject(s)
Apocynaceae/genetics , Biological Variation, Population/genetics , Seed Bank
2.
Acta sci., Biol. sci ; 42: e50353, fev. 2020. tab, map, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1460914

ABSTRACT

Phytosociological studies are essential for the elaboration of conservation strategies for the Cerrado. The goal of this study was to survey two areas of cerrado stricto sensu: Fazenda Canaã and Fazenda Providência, located in the Municipality of Porto Nacional, State of Tocantins. There were 10 plots of 100 m2 allocated in each area. All individuals with circumference equal to or greater than 10 cm, at ground height ≥10 cm were sampled, soil samples were taken for physical-chemical analysis. Sampling in Canaã resulted in 379 individuals belonging to 28 families and 50 species. In Providência, there were 300 individuals from 27 families and 49 species. The Shannon-Wiener Index for the Canaã was 3.48 and for Providência, 3.45. The studied areas presented a large number of small sized individuals, presenting a reverse J-shaped diameter structure. The Canonical Correspondence Analysis showed significant scores for the first axes (p < 0.05) according to the Monte Carlo test, which explained 70% total variability of the data. The variables with the highest structure coefficient in axis 1 were clay (0.94), pH (0.62) and magnesium (-0.32). On axis 2, the most important variables were aluminum (0.29), silt (0.25) and potassium (-0.078). These soil variables show a differentiation of the study areas.


Subject(s)
Soil Analysis , Biodiversity , Grassland
3.
Biosci. j. (Online) ; 30(2): 429-435, mar./apr. 2014. tab, ilus
Article in Portuguese | LILACS | ID: biblio-947146

ABSTRACT

O objetivo do presente trabalho foi determinar a divergência genética de 50 clones de batata-doce do Banco de Germoplasma da Universidade Federal do Tocantins com base em marcadores RAPD, bem como verificar o agrupamento gerado a partir dos dados moleculares. No ensaio foram utilizados 50 clones de batata-doce, provenientes do programa de melhoramento genético da UFT. As análises de agrupamento foram feitas utilizando-se índice de similaridade de Jacard através do método hierárquico aglomerativo UPGMA. Foi observada uma elevada variabilidade genética entre os 50 clones. Os 14 primers utilizados produziram 181 bandas, destas, 155 foram polimórficas, onde os primers A17 e A7 foram os mais informativos. A análise das distâncias genéticas mostrou que a menor variação ocorrida foi entre os clones 04.06 e 04.12 e a maior foi entre os clones 100.06 e 114.07. No total, foram formados 22 grupos e, apesar de haver um grau maior de parentesco entre determinados clones, isto é, serem meios-irmãos, alguns apresentaram similaridade menores do que os detectados entre clones não aparentados. Assim, os 50 clones provenientes do Banco de Germoplasma da UFT apresentaram elevada diversidade genética e os marcadores RAPD foram eficientes para revelar tal diversidade.


The aim of this study was to determine the genetic diversity of 50 clones of sweet potato germplasm bank of the Federal University of Tocantins based on RAPD markers, as well as check out the group generated from molecular data. Cluster analyses were made using the Jaccard similarity index and the UPGMA agglomerative method. Observed a high genetic variability among 50 clones. The 14 primers produced 181 bands, of these, 155 were polymorphic, where the primers A17 and A7 were the most informatives. The analysis of genetic distances show that the smallest variation occurred between clones 4.06 and 4.12 and most was between 100.06 and 114.07. In total, 22 groups were formed, and although there is a greater degree of kinship between certain clones, i.e. they have the same mother, some similarity values were lower than those detected between unrelated clones. Thus, 50 clones from the Germplasm Bank of UFT showed high genetic diversity and RAPD markers were efficient to reveal such diversity.


Subject(s)
Random Amplified Polymorphic DNA Technique , Ipomoea batatas , Plant Breeding , Seed Bank , Genetics
4.
Biosci. j. (Online) ; 30(2): 332-339, mar./apr. 2014. tab, ilus
Article in Portuguese | LILACS | ID: biblio-947041

ABSTRACT

Para atender à crescente demanda mundial por alimentos, haverá aumento significativo na fração dos cultivos agrícolas realizados em solos de baixa fertilidade. Com isto, diversos programas direcionaram o melhoramento de plantas para condições de estresse por baixa disponibilidade de fósforo (P). Neste contexto, duas estratégias podem ser consideradas: tolerância à baixa disponibilidade de P no solo e responsividade a sua disponibilidade. Assim, o objetivo dessa pesquisa foi identificar a relação entre tolerância a baixos níveis de P no solo e responsividade à adubação fosfatada em cultivares de milho tropical. Foram conduzidos dois experimentos no complexo de Ciências Agrárias da UNITINS (48°21"47'W; 10°24"09'S), Palmas, TO, no ano agrícola de 2004/2005. Nestes, foram avaliados 36 cultivares comerciais em duas condições contrastantes de disponibilidade de P no solo. O delineamento experimental utilizado foi látice simples (6 x 6), sendo a parcela experimental constituída de duas linhas de 5,0 m, espaçadas por 1,0 m, com densidade de semeadura de 50.000 plantas.ha-1. Foi avaliada a produtividade de grãos e os índices a) resposta à disponibilidade do nutriente, b) eficiência no uso de P em baixa disponilibilidade deste (considerado como tolerância). As cultivares mais responsivas foram NB 7361, BALU 551, SHS 4070 e SHS 4080. Por outro lado, as cultivares mais tolerantes foram XB 7253, AG 7040, CD 308, CD 307 e XB 2271. Foi observada relação negativa entre tolerância e responsividade (-0,58**) em cultivares de milho tropical.


Looking for meet the growing worldwide demand for food a significant fraction of crops can be performed on infertile soils. Thus, several programs directed the plant breeding for stress conditions due to low availability of phosphorus (P). In this context, two strategies can be considered: tolerance to low soil P availability, and responsiveness to their availability. So, the aims of this research were to identify the relationship between tolerance to low soil P levels and responsiveness to phosphorus fertilization in tropical maize cultivars. Two experiments were conducted in the Agricultural Sciences Complex of UNITINS (48°21"47'W, 10°24"09'S), Palmas, TO, in the 2004/2005 growing season. Thirty six commercial cultivars were evaluated in two contrasting P availability in soil (in each trial). The experimental design was simple lattice (6 x 6), where the plots consisted of two rows of 5.0 m, spaced by 1.0 m, with a density of 50,000 plants ha-1. The traits evaluated were grain yield and the indexes a) response to the nutrient availability; b) phosphorus use efficiency (considered as tolerance). The most responsive cultivars were NB 7361, 551 BALU, SHS 4070 and SHS 4080. On the other hand, the cultivars XB 7253, AG 7040, CD 308, CD 307 and XB 2271 were more tolerant. In addition, negative significant correlation between tolerance and responsiveness (-0.58**) in tropical maize cultivars was observed.


Subject(s)
Phosphorus , Soil , Food , Zea mays , Plant Breeding
5.
Biosci. j. (Online) ; 28(5): 833-841, sept./oct 2012. tab, ilus
Article in Portuguese | LILACS | ID: biblio-914325

ABSTRACT

O trabalho teve como objetivo caracterizar morfologicamente e estimar a variabilidade fenotípica em uma população natural de Hancornia speciosa Gomes em Porto Nacional - TO. Foram avaliadas características da planta, frutos e sementes, utilizando-se estatística descritiva, análise de componentes principais e análise de agrupamento com base no Método da Ligação Média entre Grupos - UPGMA, adotando como medida de dissimilaridade, a distância Euclidiana Média Padronizada. Observou-se considerável variabilidade na população em relação à altura da ramificação principal, volume de copa, massa de sementes, massa do fruto, massa da polpa e número de sementes. A população possui variabilidade suficiente para ser utilizada em programas de melhoramento genético e tem potencial para ser utilizada em atividades de extrativismo e agroindústria.


The study aimed to characterize morphologically and to estimate the phenotypic variability in a natural population of Hancornia speciosa in Porto Nacional - TO. Were evaluated characteristics of plant seeds, using descriptive statistics, principal component analysis (PCA) and cluster analysis method based on Unpaired Group Method of Average (UPGMA), adopting as a measure of dissimilarity the standardized average euclidian distance. There was considerable variability in the population relative to the height of the main branch, canopy volume, seed mass, fruit mass, pulp mass and seed number. The population has sufficient variability to be used in breeding programs and has the potential to be used in agribusiness and extractive activities.


Subject(s)
Apocynaceae , Genetic Enhancement , Biological Variation, Population , Agribusiness
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